Installer GeoNature Atlas App
Obtenir l'Atlas v2.x avec Git
- Se connecter sur le serveur web-srv avec :
ssh geonat@web-<region>-sinp - Se placer dans le dossier suivant :
cd ~/www/ - Cloner le dépôt de l'Atlas dans un dossier atlas/ :
git clone https://github.com/PnX-SI/GeoNature-atlas.git atlas - Se placer dans le dossier de l'Atlas et basculer sur le tag désiré :
cd ~/www/atlas/; git checkout 2.0.0 - Créer un lien symbolique depuis le dossier racine pour faciliter l'accès à l'Atlas :
ln -s ~/www/atlas ~/atlas
🗑️ Obtenir l'Atlas v1.x avec une archive
- Récupérer et afficher la dernière version :
curl -s https://api.github.com/repos/PnX-SI/GeoNature-atlas/releases/latest| grep -oP '"tag_name": "\K(.*)(?=")' - Se placer dans le dossier dwl de l'utilisateur geonat :
cd ~/dwl/ - Télécharger l'archive :
wget https://github.com/PnX-SI/GeoNature-atlas/archive/1.4.1.zip -O atlas_v1.4.1.zip - Décompresser l'archive dans le dossier www de l'utilisateur geonat :
unzip atls_v1.4.1.zip -d ~/www/ - Se rendre dans le dossier www :
cd ~/www/ - Renommer le dossier de l'Atlas (au format GeoNature ⇒ uniformité):
mv GeoNature-atlas-1.4.1 atlas_v1.4.1 - Créer un lien symbolique :
ln -s atlas_v1.4.1 atlas - Se rendre dans le dossier de Atlas :
cd atlas - Vérifier la présence dans le fichier
gunicorn_start.shdu paramètre--timeout=${gun_timeout}au lancement de Gunicorn.
Configurer l'Atlas v2
- Vérifier dans le fichier install/install_env.sh que tous les paquets Debian nécessaires à l'Atlas ont été installés lors de l'installation des dépendances de GeoNature.
- NE PAS utiliser le script
install_env.shcar nous n'utilisons pas Apache ni la version de Postgresql des dépôts Debian.
- Créer le fichier settings.ini :
cp atlas/configuration/settings.ini.sample atlas/configuration/settings.ini - Éditer le fichier settings.ini et modifier les propriétés :
vi atlas/configuration/settings.inidb_host=10.0.1.40 db_port=5432 db_name=gnatlas user_pg=geonatatlas user_pg_pass=<mot-de-passe-utilisateur-atlas> owner_atlas=geonatadmin owner_atlas_pass=<mot-de-passe-proprio-base-atlas> geonature_source=true observation_data_source=gn_synthese.synthese_atlas db_source_host=10.0.1.40 db_source_port=5432 db_source_name=geonature2db db_source_fetch_size=1000000 atlas_source_user=gnreader atlas_source_pass=<mot-de-passe-utilisateur-geonature-source> type_code="COM,DEP,PNR,SINP" type_maille="M5" altitudes=(0 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000) time=15 GEONATURE_ATLAS_DOCKER_IMAGE="ghcr.io/pnx-si/geonature-atlas:latest" COMPOSE_FILE=docker-compose.yml service_desc="GeoNature-Atlas" gun_proc_name=geonature-atlas gun_num_workers=5 # Par défaut : 2 * nombre de CPU + 1 gun_host=127.0.0.1 # Bloquer l'accès extérieur au port 5000 de l'API => mettre en place un proxy Nginx via un sous-domaine si nécessaire. gun_port=8080 gun_timeout=120
- Copier le dossier GeoNature Atlas sur l'instance DB :
rsync -av -e "ssh -p <port-ssh-db>" /home/geonat/www/atlas geonat@pdb-<region>-sinp:/home/geonat/www/ - Installer la base de données de GeoNature-Atlas puis poursuivre ici l'installation de l'application.
- Créer le dossier des logs :
mkdir ~/www/atlas/log - Créer le fichier de log de l'installation :
touch ~/www/atlas/log/install_app.log - Lancer l'installation :
./install_app.sh 2>&1 | tee install_app.log - Consulter les log envoyés à la fin de l'installation par Gunicorn dans
~/www/atlas/log/errors_atlas.logavec :tail -f ~/www/atlas/log/errors_atlas.log
jpmilcent