Configurer le module OccTax de GeoNature

Notes : c'est la commande geonature qui lance l'installation des modules du cœur de GeoNature. Or, cette commande est lancée par le script install_app.sh qui est lancé côté instance web-srv. Nous devons donc installer manuellement le schéma du module côté instance db-srv.

Se connecte à l'instance db-srv en tant que geonat : ssh geonat@db-<region>-sinp

Se placer dans le dossier du module : cd ~/www/geonature/contrib/occtax/

Lancer l'installation du schéma du module : ./install_db.sh

Par défaut, OccTax permet de sélectionner un nom associé à la liste d'ID 100. Celle-ci est fournie vide ou avec quelques noms exemples.

Voir la section "Personnaliser la liste des taxons saisissables dans le module" de la doc de GeoNature.

Pour insérer tous les noms de TaxRef inférieur ou égal au genre exécuter les requêtes suivantes :

DELETE FROM taxonomie.cor_nom_liste;
DELETE FROM taxonomie.bib_noms;
 
INSERT INTO taxonomie.bib_noms(cd_nom, cd_ref, nom_francais)
  SELECT cd_nom, cd_ref, nom_vern
  FROM taxonomie.taxref
  WHERE id_rang NOT IN (
    'Dumm','SPRG','KD','SSRG','IFRG','PH','SBPH','IFPH','DV','SBDV','SPCL','CLAD','CL',
    'SBCL','IFCL','LEG','SPOR','COH','OR','SBOR','IFOR','SPFM','FM','SBFM','TR','SSTR'
  );
 
INSERT INTO taxonomie.cor_nom_liste (id_liste,id_nom)
  SELECT 100, n.id_nom FROM taxonomie.bib_noms AS n;