Mise à jour de GeoNature Atlas

• Se connecter à l'instance db-srv : ssh admin@db-<abreviation-region>-sinp
• Lancer une nouvelle session avec Screen : screen -S "update-atlas"
• Se connecter à la base de données de l'Atlas via PSQL : psql -d "gnatlas"
  • Pour mettre à jour uniquement les observations utiliser la requête : SELECT atlas.refresh_materialized_view_data() ;
  • Pour mettre à jour uniquement les zones géographiques (à faire uniquement si le territoire a été modifié) : SELECT atlas.refresh_materialized_view_ref_geo() ;
  • Pour tout mettre à jour sans distinction (la mise à jour des données géographiques peut être longue) : SELECT RefreshAllMaterializedViews('atlas') ;
• Il est possible d'automatiser cette tâche via un cron ⇒ Dans notre cas, ce n'est pas utile…

Ci-dessous sont présentés des solutions manuelles qui sont maintenant gérées par les scripts d'importation des données SINP (CBNA, CEN-PACA). Ils utilisent automatiquement le script de gestion des zones géographiques liées à un territoire.

ATTENTION : n'exécuter pas ces requête si vous utiliser le script d'import des données du CBNA.

Créer le territoire couvert par l'Atlas dans le schéma ref_geo de la base GeoNature :

• Se placer à la racine du home de l'utilisateur admin : cd ~
• Créer un dossier pour les téléchargements : mkdir dwl
• Créer un dossier pour les données : mkdir data
• Se placer dans le dossier des téléchargements : cd ~/dwl
• Télécharger les contours administratifs français sur data.gouv.fr au format SHP : wget https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/r/4636895e-e64b-497c-a9bb-8cb49b75bd1a -O admin-express-cog_v2017-01-01.7z
• Décompresser l'archive : p7zip -d admin-express-cog_v2017-01-01.7z
• Se placer dans le dossier suivant : cd ADMIN-EXPRESS-COG_1-0SHPFRA_2017-06-19/ADMIN-EXPRESS-COG/1_DONNEES_LIVRAISON_2017-06-19/ADE-COG_1-0_SHP_LAMB93_FR/
• Créer un fichier SQL des contours des régions française : shp2pgsql -c -D -s 2154 -I REGION ref_geo.tmp_region > ~/data/region.sql;
• Se connecter à la base : psql -h 10.0.1.20 -d geonature2db -U geonatadmin
• Exécuter les commandes suivantes :

  \i  /home/admin/DATA/region.sql
   
  INSERT INTO ref_geo.bib_areas_types (type_name, type_code, type_desc, ref_name, ref_version) 
  VALUES ('Territoire SINP', 'SINP', 'Région PACA', 'IGN admin_express', 2017);
   
  INSERT INTO ref_geo.l_areas (id_type, area_name, area_code, geom, "enable")
  	SELECT ref_geo.get_id_area_type('SINP'), nom_reg, insee_reg, geom, TRUE 
  	FROM ref_geo.tmp_region 
  	WHERE insee_reg = '93';

Exemple de requête de désactivation des communes hors territoire SINP SUD-PACA. ATTENTION : après cette requête, il reste les mailles dans la base qu'il faudrait aussi supprimer.

-- Supprimer les communes inutiles pour le SINP SUD-PACA :
-- Résultats obtenus :
-- UPDATE 33895 rows
-- Durée : 4333,858 ms (00:04,334)
UPDATE ref_geo.l_areas 
  SET enable = FALSE 
  WHERE id_type = 25 
    AND id_area NOT IN (
      SELECT a.id_area 
      FROM ref_geo.l_areas AS a 
        JOIN ref_geo.li_municipalities AS m ON (a.id_area = m.id_area)
      WHERE insee_dep IN ('04', '05', '06', '13', '83', '84')
    );