Installer GeoNature DB
- Préalable : il est nécessaire d'avoir installé GeoNature sur le serveur web-srv et copié l'installation de GeoNature sur le serveur db-srv.
- Se placer dans le dossier install/ :
cd /home/geonat/www/geonature/install/ - Lancer le script d'installation de la base de données :
./install_db.sh- Si le script indique que la base de données existe déjà et que vous souhaitez l'installer ou la réinitialiser :
- ATTENTION : cette manipulation efface tout le contenu de la base !
- Éditer le fichier settings.ini avec :
vi ../config/settings.ini - Modifier le paramètre suivant :
drop_apps_db=true - Relancer le script d'installation de la base de données
- ATTENTION : une fois terminé, passer à nouveau le paramètre
drop_apps_dbdu fichier settings.ini àfalse.
Installer le schéma du module "OccTax"
- Notes : c'est la commande geonature qui lance l'installation des modules du cœur de GeoNature. Or, cette commande est lancée par le script install_app.sh qui est lancé côté instance web-srv. Nous devons donc installer manuellement le schéma du module côté instance db-srv.
- Se connecter à l'instance db-srv en tant que geonat :
ssh geonat@db-<region>-sinp - Se placer dans le dossier du module :
cd ~/www/geonature/contrib/occtax/ - Lancer l'installation du schéma du module :
./install_db.sh
Erreurs
(psycopg2.errors.DatetimeFieldOverflow) date/time field value out of range: "19/02/2020 00:00:00"
- Problème : saisie d'observation dans OccTax ne fonctionne pas.
- Origine : cela provient d'une commande de modification du fichier /etc/postgresql/*/main/postgresql.conf présente dans le script install_all.sh de GeoNature avant la version 2.3.1 (au delà, la commande a été transférée dans le script install_db.sh). Notre installation n'utilisant pas ce script n'a pas la modification correspondante.
- Solution :
- Se connecter sur l'instance db-srv :
ssh admin@db-<region>-sinp - Éditer le fichier suivant :
vi /etc/postgresql/11/main/postgresql.conf - Modifier la propriété datestyle comme suit :
datestyle = 'iso, dmy'
- Redémarrer le service :
systemctl restart postgresql - Redémarrer vos sessions de connexion à la base de données
- Vérifier la prise en compte du changement avec la requête SQL :
SHOW datestyle;
sqlalchemy.exc.OperationalError: (psycopg2.OperationalError) terminating connection due to administrator command
- Message erreur côté navigateur :
Blocage d’une requête multiorigines (Cross-Origin Request) ... sur https://taxhub.silene.eu/api/.... Raison : l’en-tête CORS « Access-Control-Allow-Origin » est manquant.
- Problème : impossible de faire apparaître la liste des taxons d'autocomplétion dans OccTax.
- Origine : lorsqu'on redémarre Postgresql alors que Taxhub est entrain d’exécuter une requête, le driver Python psycopg2 remonte une erreur.
- Solution : redémarre le service Taxhub avec la commande
supervisorctl restart taxhub. De manière générale, redémarrer les services de GeoNature après un redémarrage de Postgresql est une bonne pratique.
jpmilcent